Фонд редких книг библиотеки является особой ценностью университета. В его состав входят более 13 тысяч изданий 18, 19, начала 20 веков. Это книги, брошюры, журналы по всем отраслям знаний, атласы и изобразительные материалы, как на русском, так и на европейских языках – немецком, французском, английском и др.
Фонд насчитывает 170 названий по Казахстаннике. Хранятся как единое целое мемориальные книжные собрания и личные архивы профессоров Голованова, Бажанова, Амосова и Сарсена Аманжолова.
Так, коллекция Федора Григорьевича Голованова – это 63 красочно оформленных букваря разных лет издания на 30-ти языках. Поражает масштаб их языкового подбора – даргинский и кумыкский, казахский и армянский, венгерский и болгарский и др. Изданные в 50- 60-х годах ХХ века, в настоящее время они являются библиографической редкостью.
Два издания из редкого фонда библиотеки вошли в книжную сокровищницу республики – включены в Национальный реестр документального наследия «Память Мира»:«Русско-киргизский и киргизско- русский словарь», составленный Иш – Мухаммедом Букиным. Словарь имеет огромное значение с многих точек зрения.
Во-первых, это один из первых опытов по составлению казахско-русского и русско-казахского словаря.
Во - вторых, замечателен он тем, что, помимо казахского, русского толкования слов и понятий, даётся толкование и на арабском языке. В-третьих, была сделана первая попытка собрать и привести в порядок слова, составляющие лексикон казахского народа. Словарь был издан в Типо – Литографии С. И. Лахтина в городе Ташкенте в 1883 году с разрешения Высшего Учебного Начальства Туркестанского Края.
В собрании редкого фонда научной библиотеки имеется бесценный шедевр национальной картографии Семёна Ульяновича Ремезова, «Чертёжная книга Сибири», завершенная в 1701 году. Это рукописный атлас с надписями на русском и голландском языке. В исторической науке эта уникальная книга стала известна с 1842 года, когда было опубликовано её первое краткое описание. В 1882 году книга была издана в технике литографии, тиражом 1000 экземпляров. Каждую карту – чертёж предваряет вступление, в котором изложены причины её составления и источники.
Для ученых-исследователей особое значение имеет «Чертёж земли всей безводной и малопроходной каменной степи», на нём изображены «Земли Казачьей орды». На карте отмечены следы древних городов или построек, описана растительность многих местностей, дана картографическая характеристика Каспийского и Аральского морей с прилегающими территориями, указаны реки, озера, колодцы. В книге воплощен огромный фактический материал. Это первый свод известных, на конец 17 века данных о Сибири, Казахстане и Средней Азии.
Среди книг по «Казахстанике» такие уникальные издания, как «Первая всеобщая перепись населения Российской империи 1897 года», труды научных обществ: «Записки Семипалатинского подотдела Западно-Сибирского отдела Императорского Русского Географического Общества. Широко представлен материал по переселенческому делу и колонизации в северных и восточных областях Казахстана - «Вопросы колонизации» Вып. 1- 19.
Отдел редкой книги библиотеки ВКГУ располагает не только книгами, но и различными периодическими изданиями. Старейшим является «Сибирский вестник» (1818-1824), на страницах которого отражен материал по истории, этнографии, географии Сибири, Алтая, Казахстана.
В редком фонде имеются экземпляры «Азиатского вестника», который начал издаваться с 1825 года как продолжение «Сибирского вестника».
Наряду с этим, имеются труды таких выдающихся ученых-исследователей Казахстана, Алтая, Сибири – в частности Ядринцева Н. М.
В 1878 году, а затем в 1980, он посетил Алтай. Во время путешествия Н. М. Ядринцев исследовал реки и ледники Алтая, составил планы Катунского и Берельского ледников, определил высоту ряда горных вершин и перевалов. В редком фонде имеются его труды «Сибирь как колония», «Ссылка ссыльных в Сибири».
Редкие издания, хранящиеся в библиотеки ВКУим. С. Аманжолова, позволяют студентам, преподавателям заниматься изучением истории становления науки о Сибири, Алтае, Казахстане в целом, а также исследованием деятельности отдельных выдающихся представителей сибирско-алтайской научной интеллигенции конца 19 - начала 20 веков. Приглашаем студентов, преподавателей и сотрудников на выставку «Библиотека раскрывает фонды» в Научный читальный зал (229 аудитория)